هي أول كلية في الإعجاز العلمي في مصر، إذ تحمل الكلية على عاتقها مسؤولية تكوين وإعداد خرجين ذوي كفاءة تتحقق فيهم المخرجات التعليمية بأعلى درجات الإتقان، في جميع برامجها (البكالوريوس، الماجستير، الدكتوراه).
وتستقطب الكلية الطلاب المتميزين الراغبين في التعلم والتعرف على مجالات الإعجاز (البياني، والتشريعي، والعلمي)، ذوي دافعية مرتفعة في التعلم والإنجاز الأكاديمي؛ حتى نشكل تفاعلًا إيجابيًا بين الدكاترة والطلاب، بهدف التحسين من جودة التعليم.
مراحل الدراسة في كلية الإعجاز العلمي متنوعة من الدبلوم إلى الدكتوراه وهي كما يلي:
الدبلوم العام:
• يدرس فيه الطالب لمدة سنة واحدة، مقسمة إلى فصلين دراسيين، بواقع 100 ساعة.
البكالوريوس:
• يدرس فيه الطالب لمدة 04 سنوات، مقسمة إلى 08 فصول دراسية، بواقع 400 ساعة، مع تقديم بحث علمي (مذكرة التخرج).
الدبلوم العالي:
• يدرس فيه الطالب لمدة سنة واحدة، مقسمة إلى فصلين دراسيين، بواقع 100 ساعة.
الماجستير:
• يدرس فيه الطالب لمدة سنة واحدة، مقسمة على فصلين دراسيين، بواقع 120 ساعة، مع إعداد رسالة (رسالة التخرج).
الدكتوراه:
– إذا درس الطالب (مرحلة الماجستير) في جامعة خاتم المرسلين العالمية، يحضر الأطروحة مباشرة.
– إمّا إذا درس الطالب (مرحلة الماجستير) في جامعة أخرى، يدرس فصل دراسي واحد (التركيز على المواد الاستدراكية) أولا، ثم يحضر الأطروحة.